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眼睛是心灵的窗户，也是唯一被紫外线和可见光照射的内部器官。在眼睛内部，光化学反应非常强烈，光氧化产物积累最多，同时，眼睛的晶状体内有一套完整的抗氧化防御体系，在不断地消除光氧化的副作用。
眼睛的晶状体内的抗氧化防御体系包括酶促和非酶促两大体系，这两种体系都必须有硒的参与才能发挥作用。
实验表明，硒缺乏导致大鼠眼晶状体抗氧化能力下降，自由基产生增多，脂质过氧化作用加强，导致晶状体损伤，出现形态学改变。
除了晶状体外，睫状肌在视觉的形成方面同样具有重要的调节功能，硒在眼睛睫状肌内含量也比较高，当硒含量不足时，眼组织容易形成痉挛，导致调节性近视。
此外，有学者认为，眼睛组织中含有硒、锌、铬等多种与近视发病密切的微量元素。这些元素在体内参与许多酶的组成和代谢，当他们在体内含量不足时，这些元素的动态平衡遭到破坏，便会引起代谢紊乱，导致眼睛组织结构改变以及视力功能下降而容易患近视。目前，关于微量元素硒防控近视的机制研究尚在起步阶段。
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